“中芯一號”——GS研究利器,精選好種育好豬!
育種的核心是育種目標和選育群體,如果沒有合適的育種方法,是無法進行新品系的培育和新配套系的研發等工作的。因此,足夠了解核心育種群體的情況,依照育種目標對群體進行優化和調整是十分重要的工作。根據核心群體的狀況,利用分子技術進行GS選育,通過表型和基因型數據分析,可以幫助豬場的育種部門更好的了解和管理自己的群體。
什么是GS
GS(全基因組選擇研究)通過檢測覆蓋豬全基因組的分子標記,利用基因組水平的遺傳信息對個體豬進行遺傳評估,可以獲得更高的育種值估計準確性。對早期難以度量的性狀進行選擇,縮短世代間隔,加速育種進程,從而節約大量的育種成本。估算個體基因組育種值,對育種場選育群體進行打分排名,實現早期精準選育。
GS選擇一般需要三個步驟:
?、偈占硇秃蛡€體的SNP芯片基因型,構建參考群體;
?、诶脜⒖既后w,估計SNP標記的效應值;
?、劾肧NP效應值,估計候選群體的基因組育種值。
使用GS預期的效果
1、縮短世代間隔,實現待選群體的早期選留;
2、提高育種值估計準確性;
3、降低育種成本,減少性能測定的數量;
4、加速遺傳進展,實現20%或更多的遺傳進展。
“中芯一號”——GS研究利器
“中芯一號”作為一款SNP芯片,富集了豬的抗K88仔豬腹瀉因果位點、酸肉改良因果位點、健康脂肪酸因果位點、改良肉色緊密位點等422個性狀相關位點,涵蓋豬從出生到屠宰共10個時間點,擁有51,368個SNP位點,其中包含有81個亞洲特有地方品種位點,對家豬基因組育種研究和應用,具有高效性和精準性優勢,對我國特有豬品種的選育工作更具針對性。
“中芯一號”優點多多
一、全面性:
1、評估性狀全面:涵蓋豬從出生到屠宰整個生育期的繁殖、生長肥育、胴體、肉質、免疫等七大類、422個性狀。
2、評估群體全面:杜長大、F2資源家系、兩頭烏、蘇太、嵌合家系、萊蕪、二花臉、巴馬香、疝氣等9個群體作為參考群。
3、單倍型庫全面:目前已有涵蓋杜、長、大主要商品品種及中國六大類型地方品種高覆蓋度的基因組全序列單倍型庫。
二、先進性:
1、按功能區分標記類型:因果突變、緊密關聯、一般關聯、基因組分布位點。
2、包含控制重組率基因:可通過重組增大表型變異,增進遺傳進展。
3、等位基因效應已知:部分功能檢測不需要構建參考群,新測表型可納入現有參考群中更新效應。
4、芯片可升級:可依據增測的表型數據和填充后的基因組全序列不斷增加因果位點和緊密關聯位點數目,升級芯片。
5、重組冷熱點:考慮重組冷熱點,設計芯片分布密度。
“中芯一號”是豬育種行業內專家們群策群力,集成幾十年的科學研究成果,自主設計的育種芯片,將有效推進我國種業自主創新進程,為打造“華系種豬”品牌提供技術保障。
“中芯一號”現已上市,
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