大家好,給大家介紹一下,這是我公司的“新”片@鳳芯壹號
一轉眼漫長又短暫的國慶八天長假就過去了,這個假期玩的怎么樣?遇到了什么樣跟生物有關好玩的人或事?不妨在公眾號中跟我們分享分享。
這兩天的微博和朋友圈都被鹿晗公布戀情的微博刷屏了,眾多廠商們也紛紛來“蹭熱點”,小編也正好借此機會來給大家介紹一下我們康普森的小鮮肉@鳳芯壹號
先做個自我介紹
鳳芯壹號是由中國農業大學和北京康普森生物技術有限公司聯合研制開發的,是一款針對中國蛋雞品種的基因分型芯片。該芯片在位點設計上,以我國選育多年的高產蛋雞純系和特有的地方蛋雞品種為主,整合了已有GWAS和QTL的研究成果, 重點關注產蛋、抗病、飼料利用率、蛋品質等經濟性狀。對于國產蛋雞品種而言具有更好的適用性和更高的性價比。
芯片的位點來源
基于國內自主選育蛋雞重測序數據優選:~19K
通過對7個蛋雞品種共479只雞的基因組重測序結果進行分析,找出品種間共有和特有的SNP位點, 通過特定比例組合篩選,以保證芯片可以用于各蛋雞品種的分子育種和種質資源鑒定等工作。
基于已有的經濟性狀相關位點研究成果:~20K
1.利用Illumina Chicken 60K SNP Beadchip對白來航蛋雞40個家系600只母雞,矮小型褐殼蛋雞40個家系600只母雞進行蛋殼強度、顏色、厚度、高度等進行了GWAS研究;
2.利用Affymetrix Chicken 600K SNP Array對以白來航和東鄉綠殼蛋雞為親本組建成一個正反交群體的F2代1,512個母雞進行產蛋、蛋品質、繁殖性能、飼料利用率等經濟性狀的GWAS研究;
3.利用重測序技術對美國USDA抗病近交系(63vs72)群體進行抗病性狀研究;
4.結合已有研究成果和QTL數據庫,篩選出適合中國蛋雞育種的有效位點;從Affymetrix Chicken 600K SNP Array中優選:~11K
位點信息
優化設計:所有位點在全基因組上分布均勻且有相近的LD水平;
功能相關性:基于中國農業大學畜禽育種國家工程實驗室楊寧教授課題組的前期研究成果和現有QTL數據庫,重點與產蛋性能、抗病性狀、飼料利用效率和蛋品質等性狀相關;
適用性:芯片位點來源于在我國選育多年的高產蛋雞品種以及我國特有地方品種的重測序結果,更加適用與中國蛋雞企業進行分子育種工作;
通量適中:在蛋雞全基因組選擇育種實踐中應用性價比高基因
不同染色體片段LD水平 全基因組分布圖
探針在各個染色體上占有比例趨勢圖
看了這篇文章之后,如果您對我們的“鳳芯壹號”還有什么疑問的話,隨時歡迎您聯系我們,我們的技術人員將會給您更詳細的講解和介紹。