新聞快訊|中國農業大學與康普森生物召開?;蛐酒O計開發研討會,助力牛產業體系發展
為加快牛種業發展,中國農業大學與北京康普森生物技術有限公司經過三年多的努力,聯合開發了牛200K高密度基因芯片,滿足不同品種奶牛、肉牛的基因組選擇、品種鑒定、群體分析、基礎研究等應用,解決了基因組育種中重要的工具性問題。該芯片由國內團隊自主設計,擁有自主知識產權,芯片生產平臺依托多個平臺同時實現,既解決了高效應用問題,也解決了供應鏈上卡脖子風險。
為論證此芯片開發設計的合理性,6月5日,召開牛芯片產品線上研討會。研討會由中國農業大學動物科技學院劉劍鋒副院長主持,并邀請到各管理部門、科研專家、企業代表一同參加。
首先,中國農業大學姜力副教授對肉牛、奶牛通用芯片產品設計工作進行了設計思路及開發成果展示:
1. 我國奶牛參考群體初具規模,肉牛飼養品種多,單一品種群體規模有限;
2. 奶牛、肉牛存在大量共有SNP,但等位基因頻率存在明顯差異;
1. 在保證一定MAF的前提下,篩選多品種共有SNP為主,補充不同品種特有SNP為輔;
2. 以奶牛應用為主,兼顧大眾肉牛品種的育種應用;
1. 基因組育種,兼顧系譜鑒定、重要經濟性狀功能位點、品種鑒定等;
2. 可固相芯片、靶向捕獲測序靈活選擇,降低成本;
1. 奶牛、肉?;蚪M選擇、全基因組關聯分析、品種鑒定、親子鑒定;
2. 擴大某些性狀評估的參考群規模;
接下來,各領導專家討論中國?;蚪M育種的應用及奶牛育種生產實踐遇到的問題,對?;蛐酒M行評價并給出指導建議。
奶牛和肉牛通用芯片的研制很有意義,這款通用芯片在技術上是一個集成創新,對于這些新技術,要積極創造一個好的創新環境,支持和鼓勵新技術不斷成熟化發展。
奶牛和肉牛通用芯片的研制正當其時。目前全社會廣泛關注畜禽育種,種業振興行動方案通過后,各省都在制定地方種業振興方案,出臺一系列措施。奶牛肉牛育種聯合攻關、遺傳改良計劃也取得了一些重要進展。此款芯片的研發,對于新時期加快奶牛、肉牛育種進程、提高生產性能將產生積極促進作用。
全國畜牧總站
張處長表示這項工作對牛的育種工作來說是一個喜事,希望我們開發的育種芯片,能夠在市場推廣應用和育種體系構建方面發揮更大的作用。其次,在芯片的設計和開發過程中,從芯片的設計、檢測、數據分析一直到評估完成,要逐漸實現完全的獨立自主,這對我國種業發展是非常重要的。
基因組選擇技術優勢凸顯,在奶牛的早期選育、公??s短世代間隔方面,都起到很大的推進作用。推出一款自主研發的奶?;驒z測芯片對種業的發展、種業安全意義重大?,F在國內每年用于種公牛評估的參考群與國際相比差距很大,這款芯片如何能建立一套全面的應用體系,值得深入研究和探索,只有把模式建立起來,與商業應用結合,雙管齊下,這樣參考群不斷擴大,商業服務不斷推進,服務質量才能不斷提升。
隨后,其他專家代表及企業領導介紹了各自基因組育種工作的開展情況及在應用中的現實需求,同時對即將推出的?;蛐酒岢隽私ㄗh和展望,參會專家領導包括:天津市農業科學院研究員、天津奶牛(肉羊)產業技術體系首席專家馬毅,認為國內市場如果開發一款兼用牛育種利器將會很有前景;寧夏畜牧總站站長溫萬表示,奶牛肉牛通用芯片在解決種業卡脖子問題上有很大突破;河北省畜牧良種工作總站站長倪俊卿對利用此款芯片,如何能在選育過程中發揮優中選優的作用展開了探討;以及3位來自企業的代表,均對實際應用需求、參考群以及成本問題發表了意見。
康普森生物董事長做了關于?;蛐酒献魍茝V的展望匯報:康普森作為致力于基因組產業應用的公司,先后推出了豬、雞、大豆、玉米等一系列芯片,在產業應用上都取得了不錯的成績,此次推出?;蛐酒?,綜合考慮了國外及國內產品的現實情況。以保證質量為前提,在同等規格下,使我們的產品在國內同等產品中價格最優,能和國外的產品相媲美,讓中國的種養殖戶用上真正意義上質優價廉的國產芯片,更重要的是通過該項技術的推廣讓種業企業獲得真正的收益,促進中國種業發展。
康普森在做基因組產業推廣過程中積累了很多經驗,包括現在做的一些工作,相信在短時間內能在產業中有一個量的突破,通過量的突破來提升質的突破,未來這款芯片所服務的牛場或養牛大戶越來越多,增加我們的參考群體,提高遺傳評估體系的準確性。
此款芯片有兩個特點,一個特點是設計思路,覆蓋奶牛肉牛;第二個特點是固相芯片和靶向捕獲測序聯動,根據應用場景的不同來轉換,極大提高技術的自主性、靈活性以及成本可控性。關于育種目標聚焦和奶牛與肉牛遺傳評估體系的完善,基于芯片平臺,需要和專家同行們一起,解決包括遺傳評估體系算法、性狀測定、選擇指數制定、育種方案等問題,建立起相應的評估體系、數據體系。
康普森會盡最大的努力做到自主知識產權的全覆蓋,這也需要各位老師各位專家的幫助和支持,共同助力中國牛產業發展。
北京康普森生物技術有限公司成立于2011年,是國家高新技術企業,“專精特新”中小企業,北京市級企業科技研究開發機構??灯丈锉小懊嫦蜣r業、深入產業”,已形成科研、技術、產業相互促進的發展模式。公司先后創建基因檢測平臺、育種分析大數據平臺,智慧農業平臺,致力于打造新一代育種創新平臺。在未來的發展中,康普森生物將依托先進的測序和檢測技術、高效的信息分析能力、豐富的種質資源、以多學科結合的新型育種創新體系為基礎,為打好種業翻身仗、推動我國由種業大國向種業強國奠定基礎。