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      植物全基因組分型芯片 ——高通量、精準、性價比高                

      單核苷酸多態性(single nucleotide polymorphism, SNP) 是指基因組單個核苷酸的變異,其數量眾多、分布密集、易于檢測,使得利用SNP分型芯片來進行品種的改良已經成為現代農業研究的一個常用方法。通過植物SNP 分型芯片,檢測位點由傳統的幾十對基因提高到現在的幾千甚至幾萬個位點,檢測的準確度和通量也隨之成倍地增加。

      Plant genome SNP genotyping array

      植物全基因組SNP分型芯片

      Technological process

      技術流程

      Sample requirements

      樣本要求

      • ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

        DNA樣品

        ?總量:

        ≥ 1.0μg

        ?濃度:

        ≥ 50ng/μL

      • ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

        組織樣本

        ?總量:

        ≥ 200mg

      • ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

        細胞樣本

        ?總量:

        ≥ 1X107

      Bioinformatics Analysis

      生信分析

      • 基本分析 /Basic analysis ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
        ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
        芯片質控分析
        樣本質控分析
        SNP分型結果
        SNP Plink格式的分型結果
      • 高級分析 /Advanced analysis ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
        ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
        選擇信號分析
        時間序列分析
        親緣關系鑒定
        進化分析
        品種鑒定
        Haploview分析
        CNV分析
        全基因組關聯分析
      • 個性化分析 /Personalized analysis ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
        ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
        兩個樣本之間SNP分型差異位點統計
        兩個樣本之間相同SNP分型位點統計
        比較組間交集SNP
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