
植物全基因組分型芯片 ——高通量、精準、性價比高
單核苷酸多態性(single nucleotide polymorphism, SNP) 是指基因組單個核苷酸的變異,其數量眾多、分布密集、易于檢測,使得利用SNP分型芯片來進行品種的改良已經成為現代農業研究的一個常用方法。通過植物SNP 分型芯片,檢測位點由傳統的幾十對基因提高到現在的幾千甚至幾萬個位點,檢測的準確度和通量也隨之成倍地增加。
Plant genome SNP genotyping array
植物全基因組SNP分型芯片
Sample requirements
樣本要求
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DNA樣品
?總量:≥ 1.0μg
?濃度:≥ 50ng/μL
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組織樣本
?總量:≥ 200mg
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細胞樣本
?總量:≥ 1X107個
Bioinformatics Analysis
生信分析
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基本分析 /Basic analysis ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
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芯片質控分析樣本質控分析SNP分型結果SNP Plink格式的分型結果 -
高級分析 /Advanced analysis ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
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選擇信號分析時間序列分析親緣關系鑒定進化分析品種鑒定Haploview分析CNV分析全基因組關聯分析 -
個性化分析 /Personalized analysis ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
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兩個樣本之間SNP分型差異位點統計兩個樣本之間相同SNP分型位點統計比較組間交集SNP